| 软件 | 冲突现象 | 解决/升级版本 |
| AOL 6.x | 不兼容 | 升级至 AOL 7.0 或兼容版 6.x |
| Ghost 2001 | 不兼容 | 升级至 Ghost 2002 或更高 |
| McAfee VirusScan 4.5~5.21 | 不兼容 | 从 Windows 更新库下载兼容补丁包;旧版本须升至 6.0x |
| Outlook Express 升级丢失邮件/统计 | 从 9x/Me 升级 | 安装补丁;手动导入旧邮件存储(.dbx 文件) |
| PowerQuest Drive Image | 不兼容 | 升级至 5.0 版 |
| PartitionMagic | 不兼容 | 升级至 7.0 版 |
| QuickTime 5 | 网页嵌入视频不自动播放 | Apple 官网下载 IE6 兼容插件 |
| 远程协助失效 | 多网卡+个人防火墙 | 安装补丁 |
| Roxio Easy CD Creator 5.0 | 不兼容 | 白金版升 5.1;标准版下载 5.1 试用版等正式版 |
| Symantec Norton AntiVirus 2001 | 不兼容 | Windows 更新站点下载补丁或升 NAV 2002 |
| WinFax Pro 10 | 不兼容 | 升级至 10.02 |
| Windows Messenger 音视频 | 与 ICS/防火墙冲突、爆音回声 | 音视频冲突无补丁;爆音回声可从更新库获取补丁 |
| ZoneAlarm Pro | 阻断所有连接/导致重启 | 升级至 2.6.357 或更高 |