前文針對 FAT32 分區說明了系統還原資料夾的處理方式。若系統分區採用 NTFS 格式，嘗試存取 System Volume Information 資料夾時可能會遇到權限阻擋，因為目前用戶帳號未被加入該資料夾的安全屬性清單中。解決步驟如下：
當 Windows XP 完全無法進入時，不必急著重灌系統，仍有以下方案可嘗試：
開機時連續按 F8 呼叫進階開機選單，選擇「安全模式」。若能順利進入，退出後再嘗試正常開機，許多暫時性故障即可自癒。
操作方式同安全模式，但務必確認鍵盤上的 Num Lock 指示燈已關閉後再按下 Enter，否則可能導致選單選擇失效。
硬碟安裝法： 插入 XP 安裝光碟，執行 \i386\winnt32.exe /cmdcons，依提示完成安裝後重開機，開機選單將出現「Microsoft Windows Recovery Console」選項。
光碟啟動法： BIOS 設定光碟優先啟動，插入安裝光碟開機，畫面顯示「歡迎使用安裝程式」時按 R 進入修復主控台。輸入管理員密碼即可操作。若為多重開機需用方向鍵選擇；SCSI/RAID 硬碟開機時需按 F6 載入驅動程式。
免密碼進入技巧： 正常進入 XP 時執行 Gpedit.msc，依序展開「本機電腦原則」→「電腦設定」→「Windows 設定」→「安全性設定」→「本機原則」→「安全性選項」，雙擊「故障修復主控台：允許自動系統管理員登入」，設為「啟用」即可免輸入密碼。
修復損壞的多重開機選單： 輸入 Bootcfg /scan 掃描已安裝作業系統，再輸入 Bootcfg /rebuild 重建選單，依提示輸入載入識別碼與 fastdetect 參數即可。亦可用 Bootcfg /add 新增選單項目。
修復系統開機磁區： 在主控台命令列輸入 Fixboot 即可修復受損的開機磁區。
還原關鍵系統檔案： 若 Ntldr 遺失導致無法開機，於主控台輸入 copy x:\i386\ntldr*.* c:\（x 為光碟機代號）即可還原。若為壓縮檔遺失，可用 expand x:\i386\a.ex_ c:\windows\ 解壓還原（路徑與檔名依實際情況調整）。
啟用或禁用服務/驅動程式： 輸入 Listsvc 列出所有服務狀態，找到可疑項目後用 disable 服務名稱 禁用，或用 enable 服務名稱 啟用，以排除新安裝軟體導致的開機失敗。
