Windows 8 將大幅強化內建安全防護，微軟全面升級 Windows Defender，使其能抵禦病毒、蠕蟲、僵屍程式與 Rootkit 等所有類型惡意軟體。透過 Windows Update 同步惡意碼特徵碼，配合檔案系統過濾器即時監控，並與 UEFI Secure Boot（基於 UEFI 2.3.1 規範）深度整合，確保開機階段的韌體與更新皆受信任保護。
原僅存在於 IE 瀏覽器的 SmartScreen 篩選器，如今內建於 Windows 8 核心。當使用者首次下載或執行來自網路的應用程式，系統會自動進行信譽檢測。與 Windows 7 僅提示「發佈者未經驗證」不同，Windows 8 僅在應用程式「尚未建立信譽且存在高風險」時才主動干預，減少誤報干擾。
Windows 7 的下載警告視窗
Windows 8 智慧型 SmartScreen 提示，僅針對高風險未知應用
